Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALS2CR12Q96Q35 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALS2CR12Q96Q35 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms