Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NEUROD6Q96NK8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms