Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX22Q96L94 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms