Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPNS2Q96L46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms