Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PRAC1Q96KF2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms