Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDLIM2Q96JY6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms