Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABCC12Q96J65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABCC12Q96J65 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms