Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC51Q96ER9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC51Q96ER9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms