Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NMD3Q96D46 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NMD3Q96D46 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms