Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UPRTQ96BW1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms