Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX21Q969T3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms