Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HGDQ93099 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HGDQ93099 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HGDQ93099 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HGDQ93099 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HGDQ93099 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HGDQ93099 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms