Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RABGGTAQ92696 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
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RABGGTAQ92696 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGGTAQ92696 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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RABGGTAQ92696 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RABGGTAQ92696 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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RABGGTAQ92696 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RABGGTAQ92696 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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