Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GIPC3Q8TF64 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms