Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KLHDC9Q8NEP7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms