Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
LINC00301Q8NCQ3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms