Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNBD1Q8NA66 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNBD1Q8NA66 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms