Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZIC4Q8N9L1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZIC4Q8N9L1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms