Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC24Q8N4L8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC24Q8N4L8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms