Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX29P2Q8IUI4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms