Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNMA8AQ86V59 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNMA8AQ86V59 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms