Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRAPQ7Z569 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BRAPQ7Z569 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms