Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP50Q70EL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP50Q70EL3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms