Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAXIP1Q6ZW49 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PAXIP1Q6ZW49 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms