Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00299Q6ZSB3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms