Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP29

PQLC2, Lysosomal amino acid transporter 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2Q6ZP29 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PQLC2Q6ZP29 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms