Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CASP12Q6UXS9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CASP12Q6UXS9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms