Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CCBE1Q6UXH8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCBE1Q6UXH8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms