Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMCO3Q6UWJ1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMCO3Q6UWJ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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