Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BLOC1S2Q6QNY1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms