Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CAVIN1Q6NZI2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CAVIN1Q6NZI2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms