Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FAAP20Q6NZ36 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FAAP20Q6NZ36 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms