Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCAPH2Q6IBW4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCAPH2Q6IBW4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms