Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PRAMEF20Q5VT98 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms