Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM78BQ5VT40 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
FAM78BQ5VT40 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms