Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATAD3CQ5T2N8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms