Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NHSL1Q5SYE7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms