Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM47AQ5JRC9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM47AQ5JRC9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms