Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC93Q567U6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms