Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL22Q53GT1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.5 ms