Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACSM3Q53FZ2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACSM3Q53FZ2 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms