Protein–RNA interactions for Protein: Q30154

HLA-DRB5, HLA class II histocompatibility antigen, DR beta 5 chain, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRB5Q30154 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DRB5Q30154 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms