Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC96Q2M329 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC96Q2M329 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms