Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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RTL8BQ17RB0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RTL8BQ17RB0 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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RTL8BQ17RB0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTL8BQ17RB0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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