Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNCBQ16143 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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