Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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CYTH1Q15438 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYTH1Q15438 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CYTH1Q15438 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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