Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE3CQ15386 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE3CQ15386 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms