Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NECTIN1Q15223 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
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