Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BECN1Q14457 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BECN1Q14457 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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