Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COL4A6Q14031 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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COL4A6Q14031 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COL4A6Q14031 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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